배치표 다운로드

일괄 처리 다운로드를 시작하려면 batch_download 명령(“taxa_table.csv”, “config.txt”)을 실행하여 taxa 테이블 및 구성 파일에 대한 경로를 제공합니다. PrimerMiner는 현재 작업 디렉토리에서 각 taxa에 대한 폴더를 만듭니다(setwd(“경로/폴더”로 R로 설정)과 getwd() 현재 wd를 표시합니다. 프라이머 광부는 현재 수행 중인 작업을 알려주고 요청된 모든 그룹의 다운로드 및 클러스터링이 완료되면 보고합니다. 모든 인수는 Vizier 테이블 매개 변수를 제외한 대/소문자를 구분하지 않습니다. ArcGIS 온라인에서 다운로드하고 있습니다. 해당 매개 변수 내에서 for 루프를 사용하여 각 일치하는 테이블을 반복 할 수 있습니까? 두 목록을 모두 정렬했기 때문에 항목과 인덱스는 동일합니다. 시퀀스를 다운로드할 분류 학 그룹을 지정해야 합니다. 라틴어 이름을 사용하여 주문 및 패밀리 수준에 대한 데이터만 다운로드하는 것이 좋습니다. 다른 분류학적 수준이 작동할 수 있지만 많은 데이터(수백만 개의 시퀀스)로 다운로드되거나 Genus 이름과 같이 고유하지 않을 수 있습니다. 패키지 자습서와 함께 제공되는 taxa_small.csv 테이블을 살펴볼 수 있습니다! 모든 다운로드 매개 변수는 R에서 실행 batch_config (“config.txt”)를 생성 할 수있는 .txt 파일을 사용하여 구성됩니다.

PrimerMiner의 최신 버전을 사용하는 경우 새 구성 파일을 생성하십시오(이전 버전과의 호환성은 보장되지 않음). 현장에서 데이터를 수집하고 ArcGIS 온라인에서 다운로드하는 프로젝트를 진행하고 있습니다. 우리는 우리가 데이터를 다운로드하고 4 개의 다른 지오 데이터베이스에 넣어 곳에서 4 가지 응용 프로그램을 가지고있다. 네 개의 데이터베이스는 Elec, 사이트, 메카 및 스트루입니다. 매주 업데이트를 수행하고 필드에서 수집된 데이터를 마스터 데이터베이스에 있는 테이블에 조인해야 합니다. 업데이트해야 하는 테이블은 40개다. 파이썬 초보자이지만 알아야 할 것은 여러 데이터베이스의 여러 테이블에서 단일 데이터베이스로 레코드를 일괄 처리하는 방법입니다. 파이썬과 모델 빌더를 사용하여이 작업을 수행하려고했지만 모델은 방대하고 매개 변수가 너무 많습니다. 또한 데이터를 다운로드하는 각 데이터베이스에 대해 모델을 4 번 실행해야합니다.

문제가 부가되는 것 같습니다. 단일 테이블(테이블)을 테이블 목록(outputTable)에 추가하려고 합니다. 이 함수의 두 번째 매개 변수는 테이블 목록이 아닌 단일 테이블이 있어야 합니다. 일괄 처리 프로그램에는 두 가지 버전이 있습니다. 이전 버전에서는 HEASARC 익명 FTP 서버에서 두 개의 스크립트를 다운로드해야 합니다. 이러한 종류의 배치를 수행 하기 위해 직접 cx_Oracle 사용할 수 있습니다.: 참고: 그것은 알 수 없는 이유로 충돌 할 것 이다 맥 OSX에 다운로드 폴더에 PrimerMiner를 실행 하지 마십시오. 컴퓨터의 다른 장소인 PrimerMiner는 스크립트를 시작했지만 스키마가 일치하지 않는 오류가 발생했습니다(예: 데스크톱 또는 문서 폴더)를 잘 실행해야 합니다.

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